W praktyce występują przypadki, iż podatnicy przyjmują zasadę, zgodnie z którą odliczenia strat podatkowych lata poprzednich od dochodu danego roku dokonuje się dopiero w zeznaniu rocznym.
Praktyka taka wynika z tego, iż w ustawie o CIT brak jest przepisów, które w wprost odnosiłyby się do możliwości odliczenia strat podatkowych w ciągu roku podatkowego, poprzez odpowiednie zmieszenie kwot zaliczek miesięcznych na podatek CIT. W przepisach tych określone jest wyłącznie, iż
- o wysokość straty, poniesionej w roku podatkowym można obniżyć dochód w najbliższych kolejno po sobie następujących pięciu latach podatkowych, z tym że wysokość obniżenia w którymkolwiek z tych lat nie może przekroczyć 50% kwoty tej straty (art. 7 ust. 5 ustawy o CIT)
Minister Finansów w interpretacji indywidualnej z dnia 14 maja 2012 r., sygn. IPTPB3/423-83/12-2/PM, wydanej przez Dyrektora Izby Skarbowej w Łodzi, potwierdził jednak możliwość odliczenia poniesionych strat lat poprzednich (w wysokości maksymalnie 50% kwoty straty rocznie) już w trakcie roku podatkowego, przy obliczania zaliczek miesięcznych na podatek CIT.
Podkreśla on przy tym następujące zasady:
- wysokość odliczenia (50% kwoty poniesionej straty), należy ustalić odrębnie dla każdej ze strat podatkowych poniesionych w latach ubiegłych;
- odliczenia straty można dokonać już w trakcie roku podatkowego przy ustalaniu zaliczek na podatek, w związku z czym w takiej sytuacji brak jest podstaw do stwierdzenia, że podatnik nie dopełnił obowiązku wpłaty zaliczki lub np. zaniżył zaliczki na podatek dochodowy,
- nie ma możliwości obniżenia uzyskanego w trakcie roku podatkowego dochodu o całą kwotę poniesionej w latach wcześniejszych straty.
- w przypadku, gdy podatnik dokona odliczenia straty z lat ubiegłych w trakcie roku podatkowego, za który w zeznaniu rocznym wykaże stratę i w związku z czym nie będzie mógł skorzystać z odliczenia – nie traci prawa do odliczenia straty z lat ubiegłych, którą „zaliczkowo” odliczył. Strata, która ostatecznie nie została uwzględniona w zeznaniu rocznym, może być odliczona w kolejnych latach podatkowych.
