W przedmiotowej sprawie podmiot zainteresowany zadał pytanie o możliwości zaliczenia kosztów uzyskania przychodu w całości do odpisów amortyzacyjnych od nabycia licencji od podmiotu powiązanego. Spór dotyczył więc sytuacji, w której wnioskodawca twierdził, że skoro w przepisie (art. 15e ustawy o CIT) dotyczącym kosztów wyłączonych z kosztów uzyskania przychodu ustawodawca wprost nie odnosi się do odpisów amortyzacyjnych, to ograniczenia w zakresie zaliczania do KUP nie znajdują w tym przypadku zastosowania.
Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej nie podzielił jednak tego stanowiska. Odniósł się w głównej mierze do wykładni celowościowej przepisu twierdząc, że skoro ustawodawca wyłączył na mocy art. 15e updop określone koszty (w tym wszelkiego rodzaju opłaty i należności za korzystanie lub prawo do korzystania z licencji) – poniesione bezpośrednio lub pośrednio na rzecz podmiotów powiązanych, o których mowa w art. 11, to wyłączeniu temu podlegać będą również odpisy amortyzacyjne dokonywane od wymienionych w tym przepisie składników majątkowych.
Stanowisko przedstawione przez Dyrektora KIS jest bardzo kontrowersyjne, niemniej podatnicy powinni wziąć je pod uwagę i podjąć odpowiednie przygotowania ograniczające ryzyko powstania ewentualnych zaległości podatkowych.